面對4000多種單基因遺傳病,產前基因篩查能否把好關?

21世紀經濟報道記者 朱萍 實習生 王馨漪 北京報道 “目前從基因上面大概有4000-5000多種是明確定義的單基因遺傳病。學術界一致認可的是,包括各種隱性的、顯性的單基因遺傳病,發病率總額5%以下。”近日,中國醫學科學院北京協和醫院婦產科副主任醫師蔣宇林在接受21世紀經濟報道記者采訪時指出,單基因遺傳病是由單個基因來控制是否發病的遺傳病,分為顯性、隱性以及連鎖遺傳等類型,包括軟骨發育不全、地中海貧血、脊髓性肌萎縮癥(SMA)白化病等。
若出生后進行診療,大多癥狀嚴重且診治困難;若進行產前檢查,單基因遺傳病大多無法通過超聲、無創等常規產檢檢出,所以攜帶者篩查的重要性就凸顯出來,從檢測胎兒自身癥狀轉為篩查父母基因,從而評估胎兒患病風險,將預防窗口前移。
蔣宇林指出,對攜帶者進行篩查是去識別高危因素的一個重點方面。“如通過對孕前夫妻的遺傳學診斷,發現在某個基因上是碰對的,在孕期就可以去針對性去查,看是否遺傳了他們各自帶有的遺傳突變位點,若兩邊都遺傳,孩子很可能就是一個患者,這樣的方式,也是我們在孕期去針對宮內去做排查的比較有利的手段,但只能是針對一些常見的單基因隱性遺傳病,至于顯性病這些是沒有辦法去做預測的,因為遺傳診斷是比較復雜的。”
據了解,目前攜帶者基因篩查技術已經較為成熟,就在不久前,貝瑞基因基于ACMG(美國醫學遺傳學與基因組學學會)最新《指南》,并結合中國臨床需求,發布了可以篩查129個基因153種遺傳病的攜心安?擴展性攜帶者篩查(標準版),樣本檢測周期一般為實驗室收樣后15個工作日。
什么是單基因遺傳病?
單基因遺傳病是由單個基因來控制是否發病的遺傳病,分為顯性、隱性和性連鎖遺傳幾種類型。其特征是一個基因出現了問題或者異常而導致了相應的疾病。與之對應的還有多基因病,指病因無法歸結到某一個具體的基因的問題,可能是環境因素引起發病。比如高血壓、糖尿病,可能是與患者運動、飲食等生活習慣有關。
單基因病的病因主要是基因變異,包括遺傳和新發突變兩種類型。蔣宇林向21世紀經濟報道記者指出,總體來看,新發突變即變異的數量更多,但變異絕不是一個罕見的現象。在人類發展進化的過程中,變異時常發生,如人類變得更強壯、更聰明、對疾病的抵抗更強或者繁殖能力更好,這些都是正向的變異;同時,人類也會發生很多負向的變異,如父母在這個疾病上均沒有突變的位點,但孩子在受精卵的形成過程中出現突變。甚至,如果這種變異造成的疾病不致死、仍保留生殖能力,這種變異還將遺傳給下一代。
其中,針對隱性遺傳造成的基因疾病值得關注。如果父母中只存在一個隱性基因的攜帶者,后代并不會發病,只有父母均攜帶該隱性基因時,后代才會發病。因此,隱性遺傳更加隱蔽。此外,隱性遺傳是存在預防和改善辦法的。蔣宇林指出,正是由于可以確認夫婦是否攜帶隱性基因,醫生才可以預期發病幾率,進行疾病干預。
蔣宇林表示,很多單基因遺傳病都是罕見病,目前有大概4000種以上明確定義的單基因遺傳病。從新生兒角度來看,比較常見的單基因病有遺傳性耳聾,還有一些代謝性疾病比如甲基丙二酸血癥、苯丙酮尿癥,神經肌肉病比如脊髓肌萎縮癥、DMD(杜氏肌營養不良);在產前階段,醫生還會看到更多骨骼、腎臟和泌尿系統、心臟和顱內心結構發育相關的單基因病。
哪些單基因遺傳病比較嚴重?蔣宇林指出,由于缺乏界定“嚴重”的統一標準,沒有辦法判定哪種類型的遺傳病“更嚴重”,學術界一直存在很大爭議。而從非學術的角度來看,一般認為早期致死的遺傳病,或者必須進行復雜外科手術干預的遺傳病更加嚴重。同時,在遺傳病診斷領域,也普遍認為神經認知方面的疾病比較嚴重。
單基因遺傳病能否避免?
蔣宇林向21世紀經濟報道記者指出,在胎兒期,最大的困難是如何發現單基因遺傳病。由于單基因無法用肉眼看見,醫生只能依靠影像學評估,關注在產前檢查過程中是否發現胎兒的結構問題或者發育異常,比如羊水特別多、胎兒偏小等。但通過蛛絲馬跡來判斷胎兒是否存在問題,是非常困難的,對影像學醫生的能力有很高要求。因為很多遺傳病在宮內結構上沒有任何表現,醫生無法在胎兒外觀正常的情況下去關注胎兒是否出現問題,比如智力、語言等功能性發育是否正常。
而對于已經生下來的孩子,遺傳病診斷遇到的最大問題是兒科醫生遺傳診斷能力的差異。“我們見了很多的孩子、家庭,都是經過了很多波折,看了很多醫生。不同的醫院給出各種各樣的說法,最后終于遇到某個大夫、做了某個檢測,才診斷出是單基因遺傳病,再轉診到對口的機構就診。”蔣宇林表示,許多兒科醫生對遺傳病的診斷能力較弱,無法在患者第一次就診時就指出病因。
正因為遺傳病診斷的困難性和必要性,攜帶者篩查的出現能夠更好地預防單基因隱性遺傳病。據21世紀經濟報道記者了解,不久前,貝瑞基因發布了攜心安?擴展性攜帶者篩查(標準版),針對致病基因攜帶率高的153種單基因隱性遺傳病進行篩查,包括常染色體隱性遺傳病及X連鎖隱性遺傳病。
上述產品的市場容量十分巨大。具體而言,適用群體包括無表型、不良孕產史或遺傳病家族史的備孕期或孕早期夫婦、輔助生殖人群。而慎用的人群是高風險人群,即建議做遺傳病診斷而非篩查的人群,比如有表型、不良孕產史或家族遺傳史的夫婦、妊娠發現胎兒B超結構畸形等異常的夫婦。
對于產品是否應該涵蓋所有涉及的單基因隱性遺傳病,貝瑞基因董事長、總經理高揚向21世紀經濟報道記者指出,這是一個需要從實際出發逐步實現的問題。根據美國的ACMG《指南》,單基因隱性遺傳病基于攜帶頻率分為四個層級。第一階梯(Tier1)的疾病是中國人群里最常見、危害最大的這幾種病,最應該防治;第二階梯(Tier2)和第三階梯(Tier3)是在指定人群里攜帶率大于1/100的和1/200的,應該納入普通人群的攜帶列表。因此,貝瑞基因的產品按照《指南》要求,覆蓋了前三個層級。
ACMG指南對單基因隱性遺傳病篩查四個層級的劃分
“也有些專家認為沒有必要篩查這么多種疾病,這種觀點是從常見疾病綜合防治的角度來建議的,希望能夠在中國人群內普及、實現核心Tier1級的攜帶者篩查。但我們根據指南要求做到Tier3級,是因為攜帶率1/200已經是較高的數值,從個體家庭角度看是比較重要的。”高揚告訴21世紀經濟報道記者。另外,還有一些專家認為,如果有能力,篩查應該涵蓋所有單基因隱性遺傳病。高揚解釋,一方面,從純粹技術而言可以實現所有的篩查,但是從實際的臨床應用方面可能會導致太多的陽性結果。另一方面,這種篩查的性價比并不高。不過在未來,相信攜帶者篩查品種會伴隨著臨床診斷的實際情況納入更多的疾病。
單基因遺傳病篩查市場有多大?有專家表示,目前沒有具體統計數據,在美國該技術應用較為成熟與廣泛,根據覆蓋病種不同,定價在200至1000美元左右,含在孕產險中,由商業保險支付。“有市場預估,英國、美國每年包含單基因遺傳病篩查、新生兒篩查等檢測項目在百萬人份級別的檢測量。”
其中單基因遺傳病篩查的對象包括所有有生育需求及懷孕中的人群。高揚也進一步向21世紀經濟報道記者指出,所有想要寶寶的人群都是它所針對的市場,它跟基因病診斷不一樣,基因病診斷針對的市場是已經有基因病表現的患者;攜帶者篩查針對的是普通的、有生育需求的人的市場,無論是自然懷孕還是通過輔助生殖的手段。
基因報告解讀仍有提升空間
基因檢測、基因解讀、基因編輯和基因治療等技術正快速發展,但蔣宇林指出,目前基因治療有針對已出生的孩子進行開展,還沒有在宮內進行。雖然基因編輯技術的熱度很高,技術也在不斷發展完善,但還沒有進入臨床階段。
“基因編輯能否逆轉基因突變是沒有定性的,還有可能引起其他基因的問題,如果貿然在胎兒身上進行,就突破了倫理的底線。”蔣宇林向21世紀經濟報道記者表示。
與此同時,我國基因檢測的解讀也有提升空間,可以借鑒國外好的經驗,制定嚴格的解讀標準,規范數據的生產過程,或者引入第三方幫助對報告進行認證,把控質量,從而進一步提升解讀的準確性。
另據業內人士表示,在我國,醫療行為的執行主體必須是醫院而不能是第三方機構,也亟需加強醫學遺傳科的建設,尤其是提升核心公立醫院的能力,從而廣泛影響到整個醫療系統,實現“基層醫院可識別,上級醫院可篩查,核心醫院可診斷”的網絡化目標。
除此之外,基因解讀本身的難度也較大,對分析人員的能力要求極高。如果一個分析人員有豐富的分析經驗,對臨床疾病和數據庫的使用很熟悉,那么其解讀會更全面準確。蔣宇林指出:“基因解讀依賴于分析人員投入的時間和精力,閱讀1篇、100篇和1000篇文獻的效果是不同的,影響到分析人員搜集到信息的廣度,進而影響到解讀的質量。”
為了節約成本和時間,很多實驗室會選擇借助AI技術初篩,提高效率。但是,自動化初篩也會存在一些問題,比如遺漏一些遺傳病的可能性,比對分析做得不夠充分等。因此,蔣宇林表示,在基因解讀上,需要合理運用人類的專業經驗和AI技術,才能進一步提高基因解讀的準確性。