貝瑞基因探索地貧篩查新策略，推進第三代測序技術臨床轉化

文|余坤

近日，由貝瑞基因提供技術支持的三代地貧（即運用第三代測序技術進行地貧基因檢測）多中心臨床前瞻性研究成果在分子診斷期刊《The Journal of Molecular Diagnostics》上發表。該研究證明三代地貧覆蓋全面、精準度高、適用性廣，將有助于提升全球地貧攜帶者篩查的效率和精度，適合大規模臨床應用。

三代地貧一次到位檢測α及β地貧各類變異，準確度100%

地中海貧血簡稱地貧，是全世界最常見的遺傳病之一，全球約3.5億人口為地中海貧血基因攜帶者。該病危害嚴重，也是我國南方地區極為高發的遺傳病，尤其在廣東、廣西、海南、云南、貴州等省份，有超過10% 的人為地貧基因突變攜帶者。目前臨床上尚無經濟有效的地貧治療手段，該病患兒會給家庭和社會帶來沉重的經濟負擔，很多家庭因病致貧、因病返貧，因此地貧防治是我國健康扶貧、創建健康中國的重要戰略著力點之一。

地中海貧血攜帶者篩查是控制中重型地貧患兒出生的重要措施，貝瑞基因創新性的將第三代測序技術應用于地貧攜帶者篩查，使篩查的效率和精度全面提升。據了解，第三代測序技術的讀長是NGS的100倍以上，在臨床應用上具有諸多優勢：測序過程中無需PCR擴增、可直接對單個分子進行測序，樣本制備簡單，可以檢測到傳統PCR方法及NGS技術遺漏的變異位點，可解決基因組高度重復序列、高GC區域、拷貝數變異、大的結構變異等問題，可實現對目標基因進行全面且精準的覆蓋。

本次研究成果由中南大學醫學遺傳學研究中心聯合南方地貧高發十省12家醫院共同發表，中南大學醫學遺傳學研究中心、湖南家輝遺傳病?？漆t院的鄔玲仟教授為這項研究的通訊作者。鄔玲仟教授指出：近50個中心、近萬例地貧樣本的臨床研究結果顯示，即使面對各種疑難樣本，與各種“金標準”方法進行全面對比，三代地貧均能一次到位檢測α及β地貧各類變異，且準確度為100%。

此外，無論是提高重型地貧的防控效率、避免由于誤篩帶來的不必要的產前診斷、臨床精準遺傳咨詢等方面，三代地貧都有著不可替代的優勢。三代地貧一次性覆蓋30種以上α缺失變異、28種以上β缺失變異，超過以往所有地貧檢測方法；三代地貧能精準地檢測α基因多拷貝變異，助力α多拷貝合并β基因變異的“第三類”地貧的精準防控；能精準識別香港型及反香港型變異，避免誤篩；三代地貧能一次到位實現順反式變異的精準識別，無需家系驗證，減少孕婦及其家屬的來回奔波；對于常規基因檢測方法未能明確原因的罕見型地貧，三代地貧檢測能提升40-60%的診斷效能；對于傳統PCR及二代地貧的假陽性和假陰性，也可行三代地貧驗證。

貝瑞基因三代地貧產品全面升級，致力于臨床轉化

據了解，一直以來，貝瑞基因致力于基因檢測技術向臨床應用的全面轉化。2020年，貝瑞基因創新性的應用第三代基因檢測技術，提供覆蓋全面、極致精準的第三代地中海貧血基因檢測終極解決方案。為探索“一錘定音”地貧攜帶者基因篩查新策略，貝瑞基因啟動“地中海貧血基因圖譜（Thalassemia Gene Atlas，TiGA）計劃”，通過與國內地中海貧血防控臨床專家合作，充分利用貝瑞基因引進最先進的單分子實時測序技術和強大的生物信息分析能力，進一步完善中國人群地貧基因突變與臨床表型數據庫，促進地貧診療手段的發展。

近期，基于對“地中海貧血基因圖譜（TiGA）計劃”收集到的大量珍貴樣本的進行檢測分析，以及地貧防控專家的指導意見，貝瑞基因完成了三代地貧產品的全面升級，并根據臨床的實際需求和具體應用場景，針對性推出多款產品。同時，貝瑞基因最新研發的三代CAH新產品也即將上市。

鄔玲仟教授表示，三代測序HiFi模式的準確度高，成本可及，已滿足在地貧、CAH、SMA及FXS等單病的攜帶者篩查及新生兒篩查上大規模臨床應用的技術前提，多中心臨床前瞻性研究的數據充分證實三代地貧具有廣闊的臨床應用前景，特別是三代地貧能實現對α三聯體的精準檢測，對“第三類” 地貧的精準防控意義重大。貝瑞基因也將在此基礎上不斷加大技術創新力度，加快推進三代測序的臨床轉化應用。